La chiesa fu fondata alla fine del XIII secolo sul luogo dell'antica chiesa di Santa Maria "al prato" in una zona perifica della città.

L 'interno a navata unica, di dimensioni eccezionali, conserva lungo le pareti e nelle cappelle i più importanti cicli di affreschi di maestri trecenteschi.

Interventi della Fondazione

1990-2001   Restauro dell'organo Hill del 1896
1997   Contributo per il restauro del quadro di Elisabetta Sirani raffigurante la "Madonna con Bambino in trono con i SS. Francesco e Caterina"
2001   Restauro di n. 4 vetrate dell'abside
2002   Restauro e ricollocazione del dipinto "Riposo dalla fuga in Egitto"
2004   Restauro del portone
    Restauro pittorico interno delle pareti della chiesa di S. Francesco
2007   Restauro dell'aula della Chiesa di S. Francesco, pittura delle pareti della navata e del transetto, restauro della decorazione delle pareti della navata, con saggi stratigrafici